
Saison 3
Jack Bauer vient de terminer une opération d'infiltration dans le puissant cartel de la drogue mexicain des Salazar qui a permis l'arrestation de son chef Ramon Salazar. Cependant, Jack apprend que le frère de Ramon, Hector, s'apprête à s'emparer d'un dangereux virus mortel. Il décide alors de monter une ambitieuse opération secrète afin de s'emparer du virus.
Trois ans après la tentative d'assassinat dont il a été la victime, le Président Palmer, aidé de son frère Wayne, est en pleine campagne de réélection. Il arrive à Los Angeles où un débat doit l'opposer à son rival à la Présidence... Jack Bauer a passé la dernière année sur le terrain dans le but de coincer Ramon Salazar. Il espère obtenir de ce dernier des infos pour démanteler des cellules terroristes... Kim travaille désormais à la CAT auprès de Tony Almeida et son épouse Michelle... Un cadavre ravagé par un virus mortel a été déposé devant les bureaux des Services de Santé...
Des terroristes menacent de propager un virus mortel dans Los Angeles si Ramon Salazar n'est pas libéré. D'après le Dr Macer, ce virus agit très vite et aucun vaccin ou antidote ne sont connus. Wayne fait savoir à la CAT que le Président ne cèdera à aucune menace terroriste. Le principal suspect est Hector Salazar, le frère du détenu... Chase s'inquiète pour Jack Bauer qu'il sait accro à la drogue... De son côté, malgré les réticences du jeune homme, Kim met au courant son père de sa relation avec Chase...
Après avoir appris qu'un certain Kyle Singer a été payé pour transporter - sans le savoir - le virus dans un sachet de cocaïne, Jack tente de lui mettre la main dessus avant que le virus ne se répande. Pour cela, il fait équipe avec Nicole Duncan, chef des Services de la Santé chargée d'organiser le périmètre de sécurité... A la CAT, une taupe tient au courant Hector Salazar du cours des événements... Son père ayant trouvé la drogue, Kyle prend la fuite... Wayne tente de convaincre son frère qu'Anne n'a pas été toujours honnête avec lui...